生物净水栅对凡纳滨对虾肠道菌群组成的影响
裴鹏兵,吴洁琼,梁宏豪,杜虹
汕头大学理学院 生物系,广东 汕头 515063; 汕头大学 理学院,海洋生物研究所,广东省海洋生物技术重点实验室,广东 汕头 515063; 福建省水产研究所,福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室,福建 厦门 361013; 汕头大学 理学院,汕头大学—马尔凯理工大学藻类联合研究中心,广东 汕头 515063
Effects of Biological Water Purification Grid on Intestinal Flora Composition of Pacific White Leg Shrimp Litopenaeus vannamei
PEI Pengbing, WU Jieqiong, LIANG Honghao, DU Hong
摘要 利用Illumina Miseq高通量测序技术和生物信息学分析手段,采集传统养殖池塘和添加生物净水栅养殖池塘凡纳滨对虾肠道样品,比较分析两个池塘凡纳滨对虾肠道菌群组成及其多样性。试验结果表明,对照组和试验组凡纳滨对虾肠道测得的可操作分类单元分别为239和296。对照组和试验组对虾肠道样品菌群的物种丰度和优势菌种存在一定差异,试验组和对照组样品细菌Shannon指数分别为2.04、1.80,前者细菌Shannon指数高于后者13.33%(P >0.05)。对照组和试验组对虾肠道样品所鉴定出的细菌门类组成基本相似,组成比例存在一定差异,前三大优势细菌门类均为变形菌门、拟杆菌门和软壁菌门,分别占试验组细菌总数和对照组细菌总数的97.56%和98.54%。在优势菌群方面,试验组对虾肠道的优势群为弧菌属、希瓦氏菌属、Cloacibacterium 、黄质菌属、红杆菌属,分别占细菌总数的70.83%、18.29%、1.97%、1.38%和1.06%,对照组对虾肠道的优势群为弧菌属和希瓦氏菌属,分别占细菌总数的58.51%和37.67%。本研究分析了两种养殖池塘下对虾肠道菌群结构,试验组对虾菌群丰富度高于对照组,其多样性也高于对照组,这有助于生物净水栅更好地应用于池塘养殖。
关键词 :
凡纳滨对虾 ,
肠道菌群结构 ,
多样性 ,
高通量测序 ,
池塘养殖
Key words :
Litopenaeus vannamei
intestinal flora composition
diversity
high throughput sequencing
pond culture
引用本文:
裴鹏兵,吴洁琼,梁宏豪,杜虹. 生物净水栅对凡纳滨对虾肠道菌群组成的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 301-308.
PEI Pengbing, WU Jieqiong, LIANG Honghao, DU Hong. Effects of Biological Water Purification Grid on Intestinal Flora Composition of Pacific White Leg Shrimp Litopenaeus vannamei . 水产科学, 2018, 37(3): 301-308.
链接本文:
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2018/V37/I3/301
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