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泥东风螺线粒体基因组及其遗传多样性分析 |
熊钢,周先文,王晓清,巫旗生,康骊,秦溱,曾志南 |
湖南生物机电职业技术学院,湖南长沙 410127;水产高效健康生产湖南省协同创新中心,湖南 常德 415000;湖南农业大学,湖南 长沙 410128;福建省水产研究所,福建 厦门 361013 |
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Mitochondrial Genome and Genetic Diversity of Snail Babylonia lutosa |
XIONG Gang, ZHUO Xianwen, WANG Xiaoqing, WU Qisheng, KANG Li, QIN Qin, ZENG Zhinan |
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摘要 为研究泥东风螺线粒体基因组遗传进化和遗传多样性,采用PCR扩增和直接测序技术,对泥东风螺线粒体基因组全序列及3个野生群体线粒体基因测序,并用生物软件进行分析。研究结果表明,泥东风螺线粒体基因组上的tRNA-Met、tRNA-Tyr、tRNA-Cys、tRNA-Trp、tRNA-GLn、tRNA-Gly、tRNA-Glu和tRNA-Thr位于环形线粒体L链上;18种腹足纲动物线粒体全长基因相似性为70.1%~92.9%,种间的12S RNA和16S RNA相似性与线粒体基因组全长相似性相当;12S RNA的391~491 bp区域和16S RNA的1~106 bp和361~481 bp区域为高度变异区,而16S RNA的1191~1317 bp区域为高度保守区;以F5引物扩增测序3个野生群体,共检测到由40个多态位点组成的26个单倍型,野生群体单倍型多样性为(0.406±0.112)~(0.532±0.113),野生群体核苷酸多样性为(0.00094±0.00124)~(0.00111±0.00123);北海野生群体与连江和长乐野生群体之间的遗距离分别为0.00094和0.00099。其结果可以为泥东风螺遗传进化、人工增殖和种质资源保护评估提供参考。
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关键词 :
泥东风螺,
线粒体基因组,
环形结构,
遗传多样性
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Key words:
Babylonia lutosa
mitochondrial genome
ring structure
genetic diversity
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引用本文: |
熊钢,周先文,王晓清,巫旗生,康骊,秦溱,曾志南. 泥东风螺线粒体基因组及其遗传多样性分析[J]. 水产科学, 2019, 38(1): 26-33.
XIONG Gang, ZHUO Xianwen, WANG Xiaoqing, WU Qisheng, KANG Li, QIN Qin, ZENG Zhinan. Mitochondrial Genome and Genetic Diversity of Snail Babylonia lutosa. 水产科学, 2019, 38(1): 26-33.
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链接本文: |
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2019/V38/I1/26 |
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