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| 亲缘生物法生物信息技术在水产基因研究中的应用 |
| 唐冬生,严霞,李芳,张细权 |
| 佛山大学,生命科学学院,广东,佛山,528000,华南农业大学,动物科学学院,广东,广州,510642 |
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| Application of Bioinformatics of Relative Organisms in Fishery Genes |
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摘要 用Entrez、SRS等检索工具可从GenBank、EMBL等核酸序列数据库、鱼类专业数据库获取相关水产动物的基因等信息,通过电子邮件或网页填表等方式用BLAST、FASTA等序列分析软件来分析获得的信息,以鳜鱼rRNA基因为例,根据鳜鱼的分类树,按种、属、科、亚目、目、总目追级向上寻找亲缘关系较近的其它鱼类的rRNA基因,直到找到有价值的rRNA基因序列.将有价值的rRNA基因序列拼接成重叠群,根据重叠群设计引物、克隆鳜鱼的rRNA基因,获得鳜鱼的3个rRNA基因及其间隔序列.为经济动物的基因研究建立了一种亲缘生物法的生物信息学技术.
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收稿日期: 2004-08-25
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