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| 中华鳖体表和体内菌群多样性分析 |
| 胡广洲,李登峰,苏秀榕,李太武,贺静静 |
| 应用海洋生物技术教育部重点实验室,宁波大学,生命科学与生物工程学院,浙江,宁波,315211 |
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| Phylogenetic Diversity of External and Internal Bacteria Associated with Soft-shelled Turtle(Trionyx sinensis) |
| HU Guang-zhou,LI Deng-feng,SU Xiu-rong,LI Tai-wu,HE Jing-jing |
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摘要 采用16S rDNA分析方法,分别提取中华鳖体表和体内细菌总DNA,以之为模板进行PCR扩增获得细菌16S rDNA基因片段,并构建16S rDNA克隆文库.从2个文库中分别随机选取100个重组克隆子,抽提重组质粒,用Hae Ⅲ和MspⅠ限制性内切酶进行酶切,获得酶切指纹图谱,从每种图谱随机挑选克隆子测序,获得其16S rDNA部分序列,构建了系统进化树.在中华鳖体表和体内细菌克隆文库中分别包含13种和10种RFLP谱型,分别挑选了70个和60个克隆子进行测序.结果表明,中华鳖体表和体内文库克隆子分别归为15类和11类OTU,体表和体内菌群多样性较强,优势细菌类群分别为拟杆菌和变形菌,并在文库中检测到了几株益生菌和条件致病菌.
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收稿日期: 2010-07-25
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| 引用本文: |
胡广洲,李登峰,苏秀榕,李太武,贺静静. 中华鳖体表和体内菌群多样性分析[J]. , 2010, 29(7): 393-398.
HU Guang-zhou,LI Deng-feng,SU Xiu-rong,LI Tai-wu,HE Jing-jing. Phylogenetic Diversity of External and Internal Bacteria Associated with Soft-shelled Turtle(Trionyx sinensis). , 2010, 29(7): 393-398.
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| 链接本文: |
| http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2010/V29/I7/393 |
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