基于mtDNA-COⅡ基因序列对中国南海裸胸鳝属鱼类分子系统进化关系的研究
齐兴柱,尹绍武,张本,霍蕊,杜民
海南大学,热带生物资源教育部重点实验室,海南,海口,570228
Molecular Phylogenetic Relationships among Six Species in Moray Eels Gymnothorax sp in South China Sea by Cytochrome Oxidase Ⅱ Gene Sequences
QI Xing-zhu,YIN Shao-wu,ZHANG Ben,HUO Rui,DU Min
摘要 采用聚合酶链式反应直接测序法,获得细斑裸胸鳝、黄纹裸胸鳝、云纹裸胸鳝、黑点裸胸鳝、褐裸胸膳5种裸胸鳝属鱼类的细胞色素氧化酶Ⅱ(cytochrome oxidaseⅡ,COⅡ) 基因序列(691 bp).结合GenBank上蠕纹裸胸鳝COⅡ同源序列,采用多个生物软件对6种裸胸鳝属鱼类序列变异和碱基组成进行分析,共发现196个核苷酸位点存在变异(28.36%);计算了它们的相对遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,6 种裸胸鳝属鱼类的序列差异为0.012～0.199,其中云纹裸胸鳝与褐裸胸鳝的序列差异最大,为0.199,细斑裸胸鳝与黄纹裸胸鳝序列的差异最小,为0.012;总体来说,序列中的转换明显多于颠换,转换和颠换的比值(Ts/Tv)为2.7;以长鳝为外群构建NJ、ME、MP系统树,长鳝分为独立的一支,6种裸胸鳝为另外一支,分为3个平行进化的分支.
收稿日期: 2010-10-25
引用本文:
齐兴柱,尹绍武,张本,霍蕊,杜民. 基于mtDNA-COⅡ基因序列对中国南海裸胸鳝属鱼类分子系统进化关系的研究[J]. , 2010, 29(10): 605-609.
链接本文:
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2010/V29/I10/605
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