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大鳞副泥鳅mtDNACytb基因序列分析及分子系统发育研究 |
胡建华,祖国掌,荣朝振,孙守旗,孙棠丽 |
安徽农业大学动物科技学院,安徽合肥,230036,怀远县水产技术推广中心,安徽怀远,233400,怀远县渔业科技发展有限责任公司,安徽怀远,233440 |
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Analysis of Mitochondrial DNA Cytochrome b Gene Sequence and Molecular Phylogeny in Paramisgurnus dabryanus Sauvage |
HU Jian-hua,ZU Guo-zhang,RONG Chao-zhen,SUN Shou-qi,SUN Tang-li |
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摘要 对15尾大鳞副泥鳅的线粒体细胞色素b基因进行PCR扩增和正反测序,获得长度为1140 bp的细胞色素b基因同源片断.所有序列中共检测到15种单倍型,序列中共出现81个变异位点,总变异率为7.1%.各单倍型的变异全部是转换或颠换,无插入和缺失,转换/颠换比为6.36.变异位点在3位密码子中的分布呈现偏倚,密码子第3位的变异占总变异的85.18%,而第1和第2位均只占7.41%.A、T、C、G碱基的平均含量分别为27.4%、30.8%、26.5%、15.3%,A+T>C+G.在所得序列中,密码子第1位上4种碱基使用较为均衡;第2位上碱基T的使用率高达41%,碱基G的使用率低至13.2%;第3位上碱基A的使用率为37.9%,而碱基G的使用率仅为7.0%.以红尾副鳅为外群用邻接法构建分子系统进化树.结果显示,在系统地位上大鳞副泥鳅与黑龙江泥鳅有较近的亲缘关系.
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收稿日期: 2011-09-25
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引用本文: |
胡建华,祖国掌,荣朝振,孙守旗,孙棠丽. 大鳞副泥鳅mtDNACytb基因序列分析及分子系统发育研究[J]. , 2011, 30(9): 551-554.
HU Jian-hua,ZU Guo-zhang,RONG Chao-zhen,SUN Shou-qi,SUN Tang-li. Analysis of Mitochondrial DNA Cytochrome b Gene Sequence and Molecular Phylogeny in Paramisgurnus dabryanus Sauvage. , 2011, 30(9): 551-554.
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链接本文: |
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2011/V30/I9/551 |
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