|
|
|
| 基于CO Ⅰ的中国西施舌DNA条形码 |
| 孟学平,高如承,申欣,郑雯雯,赵娜娜,程汉良,田美 |
| 淮海工学院海洋学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,江苏连云港222005,福建师范大学生命科学学院,福建福州,350108,淮海工学院海洋学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,江苏连云港222005;南京农业大学资源与环境科学学院;江苏省海洋生物重点实验室,江苏南京210095 |
|
| DNA Barcodes of Clam Coelomactata antiquata (Bivalvia: Veneroida)in China Based on CO Ⅰ Gene |
| MENG Xue-ping,GAO Ru-cheng,SHEN Xin,ZHENG Wen-wen,ZHAO Na-na,CHENG Han-liang,TIAN Mei |
|
|
|
摘要 以我国大连(DL)、日照(RZ)、启东(QD)、长乐(CL)、漳州(ZZ)和北海(BH)6个野生群体西施舌为研究对象,用引物LCO1490和HCO2198扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段序列,PCR产物双向测序,用ClustalX进行DNA序列比对,用MEGA4.1和PhyML软件构建NJ树和ML树,用Arlequin3.11软件进行分子方差分析,研究CO Ⅰ这一特定基因区段作为DNA条形码在识别西施舌地理群体的可行性和有效性.结果获得658 bp的CO Ⅰ核苷酸片段,其T、C、A、G含量分别为42.4％、14.8％、21.8％、21.0％,A+T(64.2％)含量明显高于G+C含量.变异位点占15.3％(101/658),其中简约信息位点占14.1％.群体内遗传距离为0.0020～0.0043,群体间遗传距离为0.0024～0.0883.群体间氨基酸序列无变异.长乐、漳州群体(DH组)与其他群体(HB组)间有显著的遗传分化(FST=0.956～0.970).NJ树和ML树显示长乐、漳州群体聚为一支,北方的大连、日照、启东群体和南方的北海群体聚为置信度较高的另一支(BPN=99),2支间的遗传距离为0.0837,是2支内群体间遗传距离的17.8～23.5倍.本研究结果表明,CO Ⅰ基因片段序列作为鉴定福建西施舌条形码是可行的,但不能将其余群体区别开来.
|
|
|
收稿日期: 2011-10-25
|
| 引用本文: |
孟学平,高如承,申欣,郑雯雯,赵娜娜,程汉良,田美. 基于CO Ⅰ的中国西施舌DNA条形码[J]. 水产科学, 2011, 30(10): 626-630.
MENG Xue-ping,GAO Ru-cheng,SHEN Xin,ZHENG Wen-wen,ZHAO Na-na,CHENG Han-liang,TIAN Mei. DNA Barcodes of Clam Coelomactata antiquata (Bivalvia: Veneroida)in China Based on CO Ⅰ Gene. Fisheries Science, 2011, 30(10): 626-630.
|
|
|
|
| 链接本文: |
| http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2011/V30/I10/626 |
| [1] |
曾彩虹, 边晨晨, 孙健, 吉红, 李汉东, 胡泽超. 激活线粒体自噬对草鱼脂肪细胞凋亡和生长发育的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 171-180. |
| [2] |
曹婧璇, 邹建宇, 徐宾铎, 孙利东, 纪毓鹏. 长山列岛邻近海域甲壳类群落种类组成及多样性[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 181-190. |
| [3] |
王玉全, 范思宁, 于怡琳, 梅杰, 孙娜, 梁晓晨, 刘学深, 李晓东. 稻蟹共生模式下中华绒螯蟹捕食灰飞虱的研究[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 191-201. |
| [4] |
宋桂文, 黄翔, 张娣, 颜雨, 金海平, 徐园园, 戴宏亮, 刘福利. 多组中国南、北方海带品种杂交后代生长和光合效率的杂种优势评价[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 202-211. |
| [5] |
吴晨, 骆小年, 段友健, 李姣, 邢雨忻, 季辰跃, 李权森. 北方须鳅仔稚鱼发育观察及饥饿不可逆点的确定[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 212-222. |
| [6] |
吕丽斌, 刘超, 孙明珠, 徐爱玲, 宋志文. 两种微藻对凡纳滨对虾养殖系统水质与生物膜菌群结构的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 223-234. |
| [7] |
任鹏, 张兴志, 刘敬灿, 吕淑果, 王爱民, 刘春胜. 3种饵料微藻对马氏珠母贝生理代谢和碳氮收支的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 235-243. |
| [8] |
马可馨, 李逸帆, 杨悦瑶, 李川, 郭文轩, 庄子昕, 王伟, 周贺. 杂交三倍体泥鳅减数分裂相关基因Dmc1启动子甲基化分析[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 244-253. |
| [9] |
王红岩, 张怀, 姜厚权, 郭相旭, 赵普, 王欣淼, 郑世燕, 王强. 乙酸钠添加对斜生栅藻处理紫菜加工废水效果的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 254-263. |
| [10] |
倪泳一, 温健, 李宜锴, 余为, 吴峰. 基于垂直水温的中国东海日本鲭生境适宜性分析[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 264-273. |
| [11] |
梁一帆, 吴建绍, 李慧耀, 杨求华, 郭松林, 李昭杰, 林琪. 美人鱼发光杆菌抑菌中草药的筛选及应用试验[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 274-283. |
| [12] |
朱泽伟. 长三角地区水产养殖尾水污染特征及处理效果[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 284-294. |
| [13] |
朱喜锋, 李诗洋, 胡俊茹, 梁浩辉, 黄燕华, 周萌, 王国霞. 大口黑鲈稚鱼赖氨酸需求量研究[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 295-302. |
| [14] |
董浩淼, 王方轶, 徐栋, 焦绪栋, 王维忠. 不同生长速率单环刺螠幼体肠道菌群差异分析[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 303-312. |
| [15] |
陈星合, 贾心悦, 温志新, 李亚洁, 王冬, 都兴范. 柞蚕免疫蛹粉对中间球海胆生长和免疫的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 313-319. |
|
|
|
|
