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| 鲟类线粒体基因组分子标记、遗传距离及系统演化分析 |
| 申欣,田美,孟学平,程汉良,彭永兴,李士虎 |
| 淮海工学院海洋学院,江苏连云港222005;中国科学院海洋研究所,山东青岛266071,淮海工学院海洋学院,江苏连云港,222005 |
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| Molecular Marker,Genetic Distance and Phylogenetic Analysis in Mitochondrial Genomes in Acipenseriformes |
| SHEN Xin,TIAN Mei,MENG Xue-ping,CHENG Han-liang,PENG Yong-xing,LI Shi-hu |
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摘要 鲟形目鱼类9个物种线粒体基因组的基因组成高度保守,均编码37个基因,长度为16438bp(达氏鲟)～16760bp(欧洲鳇).主编码链的A+T含量为53.3％(密苏里铲鲟)～54.6％(中华鲟和匙吻鲟).9个蛋白质编码基因(atp6、atp8、cob、coxl、cox3、nadl、had3、nad4和nad4L)编码氨基酸数目相同,分别为227、55、380、517、261、324、116、460和98个.15个主编码基因的差异位点分析表明,在鲟形目鱼类分子生态和群体遗传的研究中,had5、nad4、coxl和cob基因是理想的分子标记,可用于分析其不同物种和群体之间的遗传多样性.在9种鲟形目鱼类中,遗传距离最小的是中华鲟与俄罗斯鲟(0.0070),遗传距离最大的是闪光鲟与白鲟(0.1777).2个科之间的遗传距离远远大于科内部的遗传距离,因此支持传统的科级分类.基于线粒体基因组的系统发育结果表明,鲟形目鱼类分为2支:鲟科的7个物种和匙吻鲟科的2个物种分属2个类群(BPN=100,BPM=100,BPP=100),这与经典的系统分类观点一致.隶属于鲟属的中华鲟、俄罗斯鲟及闪光鲟与欧洲鳇聚类,支持率非常高(BPN=100,BPM=100,BPP=100),而将同为鲟属的高首鲟和达氏鲟排除在外,从而表明,线粒体基因组的数据支持将欧洲鳇并人鲟属.基于线粒体基因组数据支持鲟科内部的亲缘关系为:{[(中华鲟+俄罗斯鲟)+闪光鲟]+欧洲鳇}+(高首鲟+达氏鲟),密苏里铲鲟与它们关系最远.
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收稿日期: 2012-07-25
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| 引用本文: |
申欣,田美,孟学平,程汉良,彭永兴,李士虎. 鲟类线粒体基因组分子标记、遗传距离及系统演化分析[J]. 水产科学, 2012, 31(7): 413-418.
SHEN Xin,TIAN Mei,MENG Xue-ping,CHENG Han-liang,PENG Yong-xing,LI Shi-hu. Molecular Marker,Genetic Distance and Phylogenetic Analysis in Mitochondrial Genomes in Acipenseriformes. Fisheries Science, 2012, 31(7): 413-418.
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| 链接本文: |
| http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2012/V31/I7/413 |
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