|
|
仿刺参线粒体全基因组序列结构及比较研究 |
李云峰,李梦遥,王健,高祥刚,赫崇波,周遵春,杨爱馥 |
辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物重点实验室,辽宁省应用海洋生物技术开放实验室,辽宁大连116023,辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物重点实验室,辽宁省应用海洋生物技术开放实验室,辽宁大连116023;辽宁师范大学生命科学学院,辽宁大连 116029 |
|
Comparative Structure of Complete Mitochondrial Genome in Sea Cucumber Apostichopus japonicus |
LI Yun-feng,LI Meng-yao,WANG Jian,GAO Xiang-gang,HE Chong-bo,ZHOU Zun-chun,YANG Ai-fu |
|
摘要 利用已构建的仿刺参cDNA文库得到的线粒体DNA(mtDNA)相关基因序列设计扩增引物,测定了大连仿刺参线粒体基因组全序列,并对其进行了基因构成和进化分析.仿刺参线粒体基因组序列长16 109 bp,其基因构成与其他后口动物基本一致,包括37个基因(2个rRNA基因、22个tRNA基因和13个蛋白质编码基因)和3个主要的非编码区.在其37个基因中,ND6、tRNAScr(AGN)、tRNAGln、tRNAAla、tRNAVal、TrnaAsp位于L链上,其余均位于H链上.在13个蛋白质编码基因中,除ND1的起始密码子为GTG外,其余均以ATG作为起始密码子;除Cytb以“T”作为终止密码子外,其他蛋白质基因均具有完全的终止密码子,且在已知的棘皮动物线粒体蛋白质基因中,部分基因的起始和终止密码子表现出一定的纲内特异性.比较分析了大连、青岛、威海仿刺参线粒体基因组,三者的基因组成和排列相同,碱基组成相近,蛋白质编码基因的起始和终止密码子完全一致,但存在核苷酸和氨基酸序列的差异.三者的控制区序列存在多个插入/缺失和SNP位点.根据COI、Cytb和ND4计算了三者之间的遗传距离为0.006~0.018,遗传距离分析和系统进化关系分析都显示青岛仿刺参和威海仿刺参的关系较大连仿刺参更近.
|
|
收稿日期: 2012-08-25
|
引用本文: |
李云峰,李梦遥,王健,高祥刚,赫崇波,周遵春,杨爱馥. 仿刺参线粒体全基因组序列结构及比较研究[J]. , 2012, 31(8): 454-462.
LI Yun-feng,LI Meng-yao,WANG Jian,GAO Xiang-gang,HE Chong-bo,ZHOU Zun-chun,YANG Ai-fu. Comparative Structure of Complete Mitochondrial Genome in Sea Cucumber Apostichopus japonicus. , 2012, 31(8): 454-462.
|
|
|
|
链接本文: |
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2012/V31/I8/454 |
[1] |
沈兆媛,鲁建飞,许丹,吕利群. 中草药饲料添加剂对异育银鲫感染Ⅱ型鲤疱疹病毒的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 289-294. |
[2] |
陈仲,蒋经伟,高杉,孙红娟,董颖,周遵春. 不同病原菌刺激后仿刺参幼参体腔细胞中免疫相关酶的应答变化[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 295-300. |
[3] |
裴鹏兵,吴洁琼,梁宏豪,杜虹. 生物净水栅对凡纳滨对虾肠道菌群组成的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 301-308. |
[4] |
王晓光,王兴兵,寇凌霄,石俊艳,肖祖国,魏宏祥,刘勇,李军,骆小年. 北方须鳅的耗氧节律、耗氧率和窒息点的研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 309-315. |
[5] |
马小康,吴小嫚,胡乐琴. 2种活菌饲料对金鲫幼鱼肠道及水体微生态的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 316-323. |
[6] |
程逍妹,陈子廷,颜志波,赵培雅,王方海,李广宏. 蝇蛆蛋白对凡纳滨对虾生长、免疫及肌肉成分的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 324-329. |
[7] |
张清雯,陈超,陈建国,刘玲,赵亭亭,张庆文. 镧对条纹锯鮨组织抗氧化酶及Na+/K+-ATP酶活性的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 330-335. |
[8] |
江飚,王晶,罗恒利,陈佳,李国清,李安兴. 福尔马林对防治大黄鱼刺激隐核虫病的研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 336-341. |
[9] |
周胜杰,胡静,马振华,陈旭,杨其彬,杨蕊,刘亚娟,孟祥君. 尖吻鲈尾部骨骼胚后发育研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 342-347. |
[10] |
陈璇,张飞飞,陈志永,隗黎丽,范玉顶,张家奇,徐敏,汤百福,刘彧,钟其旺. 不同测定方法对聚维酮碘杀菌效果的比较研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 348-353. |
[11] |
唐笑,黄凯,杨淇龄,罗志远,武林华,左腾. 高效液相色谱法检测罗非鱼血浆中L-肉碱的方法研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 354-360. |
[12] |
杨俊丽,吴雪,李希磊,崔龙波. 莱州湾扇贝养殖区表层沉积物质量评价[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 361-367. |
[13] |
韩耀全,何安尤,蓝家湖,吴伟军,李育森,王大鹏,雷建军,施军. 乌原鲤的胚胎发育特征[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 368-373. |
[14] |
罗志远,周宇,杨淇龄,黄凯,唐笑,武林华. L-肉碱在罗非鱼体内的药代动力学[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 374-378. |
[15] |
陈明强,陈旭,李有宁,吴洽儿,于刚,马振华,邢孔武,王理. 美济礁合浦珠母贝吊笼养殖试验[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 379-383. |
|
|
|
|