|
|
|
| 栉孔扇贝转录组来源单核苷酸多态性位点的多态性分析 |
| 李玲,包振民,李纪勤,王师,张玲玲,陆维,胡晓丽 |
| 中国海洋大学 海洋生物遗传育种教育部重点实验室,山东 青岛,266003 |
|
| Evaluation of SNPs from Transcriptome Dataset in Zhikong Scallop Chlamys farreri |
| LI Ling,BAO Zhen-min,LI Ji-qin,WANG Shi,ZHANG Ling-ling,LU Wei,HU Xiao-li |
|
|
|
摘要 应用高分辨率熔解曲线技术对栉孔扇贝转录组来源的单核苷酸多态性位点进行验证分型和多态性分析.根据栉孔扇贝转录组单核苷酸多态性位点序列信息,对其中150个位点设计引物和探针,在4个栉孔扇贝野生群体中进行验证分型.其中,103对引物扩增出目的产物,76个位点成功分型,58个多态位点中51个是二等位多态性单核苷酸多态性(34.0％).进一步在荣成野生群体中对51个二态单核苷酸多态性位点进行多态性验证和群体遗传学分析,其中49个位点呈现多态性,且均为二态,最小等位基因频率为0.0610～0.5000,观测杂合度和期望杂合度分别为0.0833～0.8889和0.0833～0.5833.经Boferroni校正,有2个位点(C1630S115_AG和C19848S286_CA)在该群体中偏离Hardy-Weinberg平衡.各位点之间未检测到连锁不平衡.这些多态单核苷酸多态性位点可用于栉孔扇贝连锁图谱构建、分子标记辅助育种以及数量性状的基因定位等遗传学研究.
|
|
|
收稿日期: 2012-12-25
|
| 引用本文: |
李玲,包振民,李纪勤,王师,张玲玲,陆维,胡晓丽. 栉孔扇贝转录组来源单核苷酸多态性位点的多态性分析[J]. 水产科学, 2012, 31(12): 732-740.
LI Ling,BAO Zhen-min,LI Ji-qin,WANG Shi,ZHANG Ling-ling,LU Wei,HU Xiao-li. Evaluation of SNPs from Transcriptome Dataset in Zhikong Scallop Chlamys farreri. Fisheries Science, 2012, 31(12): 732-740.
|
|
|
|
| 链接本文: |
| http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2012/V31/I12/732 |
| [1] |
曾彩虹, 边晨晨, 孙健, 吉红, 李汉东, 胡泽超. 激活线粒体自噬对草鱼脂肪细胞凋亡和生长发育的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 171-180. |
| [2] |
曹婧璇, 邹建宇, 徐宾铎, 孙利东, 纪毓鹏. 长山列岛邻近海域甲壳类群落种类组成及多样性[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 181-190. |
| [3] |
王玉全, 范思宁, 于怡琳, 梅杰, 孙娜, 梁晓晨, 刘学深, 李晓东. 稻蟹共生模式下中华绒螯蟹捕食灰飞虱的研究[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 191-201. |
| [4] |
宋桂文, 黄翔, 张娣, 颜雨, 金海平, 徐园园, 戴宏亮, 刘福利. 多组中国南、北方海带品种杂交后代生长和光合效率的杂种优势评价[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 202-211. |
| [5] |
吴晨, 骆小年, 段友健, 李姣, 邢雨忻, 季辰跃, 李权森. 北方须鳅仔稚鱼发育观察及饥饿不可逆点的确定[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 212-222. |
| [6] |
吕丽斌, 刘超, 孙明珠, 徐爱玲, 宋志文. 两种微藻对凡纳滨对虾养殖系统水质与生物膜菌群结构的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 223-234. |
| [7] |
任鹏, 张兴志, 刘敬灿, 吕淑果, 王爱民, 刘春胜. 3种饵料微藻对马氏珠母贝生理代谢和碳氮收支的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 235-243. |
| [8] |
马可馨, 李逸帆, 杨悦瑶, 李川, 郭文轩, 庄子昕, 王伟, 周贺. 杂交三倍体泥鳅减数分裂相关基因Dmc1启动子甲基化分析[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 244-253. |
| [9] |
王红岩, 张怀, 姜厚权, 郭相旭, 赵普, 王欣淼, 郑世燕, 王强. 乙酸钠添加对斜生栅藻处理紫菜加工废水效果的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 254-263. |
| [10] |
倪泳一, 温健, 李宜锴, 余为, 吴峰. 基于垂直水温的中国东海日本鲭生境适宜性分析[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 264-273. |
| [11] |
梁一帆, 吴建绍, 李慧耀, 杨求华, 郭松林, 李昭杰, 林琪. 美人鱼发光杆菌抑菌中草药的筛选及应用试验[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 274-283. |
| [12] |
朱泽伟. 长三角地区水产养殖尾水污染特征及处理效果[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 284-294. |
| [13] |
朱喜锋, 李诗洋, 胡俊茹, 梁浩辉, 黄燕华, 周萌, 王国霞. 大口黑鲈稚鱼赖氨酸需求量研究[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 295-302. |
| [14] |
董浩淼, 王方轶, 徐栋, 焦绪栋, 王维忠. 不同生长速率单环刺螠幼体肠道菌群差异分析[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 303-312. |
| [15] |
陈星合, 贾心悦, 温志新, 李亚洁, 王冬, 都兴范. 柞蚕免疫蛹粉对中间球海胆生长和免疫的影响[J]. 水产科学, 2025, 44(2): 313-319. |
|
|
|
|
