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头足纲线粒体基因组结构分析 |
赵娜娜,孟学平,申欣,程汉良,阎斌伦,郑立波,朱笑琳,刘兆普 |
南京农业大学资源与环境科学学院,江苏海洋生物重点实验室,江苏南京210095;淮海工学院海洋学院,江苏海洋生物技术重点实验室,江苏连云港222005,淮海工学院海洋学院,江苏海洋生物技术重点实验室,江苏连云港222005,南京农业大学资源与环境科学学院,江苏海洋生物重点实验室,江苏南京210095 |
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Analysis of Mitochondrial Genome Characteristics in Cephalopoda |
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摘要 用生物信息学方法,利用GenBank线粒体基因组全序列信息,对头足纲15个物种基因组结构进行了分析,结果显示头足纲线粒体基因组长度为15 617~20 306 bp,基因组编码链的A+T含量为59.58%~78.12%,表现出不同程度的AT偏好性;15个物种的线粒体基因组PCGs相对保守,有2个共同的基因块,可作为头足类的线粒体基因组标志;萤乌贼、鸢乌贼、茎柔鱼、太平洋褶柔鱼、大王乌贼PCGs cox1、cox2、cox3、atp6、atp8为双拷贝,且重复基因的变异很小,这是头足纲物种不同于其他物种的显著特征;多数PCGs以ATG为起始密码,以TAA为终止密码,在cox2、cob、nad2-nad6中存在不完全终止密码;在13个PCGs中,nad2和nad4L的差异最大,atp8和cox1最保守;15个种类的遗传距离为0.033~0.561,大脐鹦鹉贝与其他种类的遗传距离最大(0.529~0.561);基于线粒体基因组编码蛋白质氨基酸序列的系统发育分析结果与形态学分类结果一致.
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收稿日期: 2013-03-25
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[1] |
沈兆媛,鲁建飞,许丹,吕利群. 中草药饲料添加剂对异育银鲫感染Ⅱ型鲤疱疹病毒的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 289-294. |
[2] |
陈仲,蒋经伟,高杉,孙红娟,董颖,周遵春. 不同病原菌刺激后仿刺参幼参体腔细胞中免疫相关酶的应答变化[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 295-300. |
[3] |
裴鹏兵,吴洁琼,梁宏豪,杜虹. 生物净水栅对凡纳滨对虾肠道菌群组成的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 301-308. |
[4] |
王晓光,王兴兵,寇凌霄,石俊艳,肖祖国,魏宏祥,刘勇,李军,骆小年. 北方须鳅的耗氧节律、耗氧率和窒息点的研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 309-315. |
[5] |
马小康,吴小嫚,胡乐琴. 2种活菌饲料对金鲫幼鱼肠道及水体微生态的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 316-323. |
[6] |
程逍妹,陈子廷,颜志波,赵培雅,王方海,李广宏. 蝇蛆蛋白对凡纳滨对虾生长、免疫及肌肉成分的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 324-329. |
[7] |
张清雯,陈超,陈建国,刘玲,赵亭亭,张庆文. 镧对条纹锯鮨组织抗氧化酶及Na+/K+-ATP酶活性的影响[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 330-335. |
[8] |
江飚,王晶,罗恒利,陈佳,李国清,李安兴. 福尔马林对防治大黄鱼刺激隐核虫病的研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 336-341. |
[9] |
周胜杰,胡静,马振华,陈旭,杨其彬,杨蕊,刘亚娟,孟祥君. 尖吻鲈尾部骨骼胚后发育研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 342-347. |
[10] |
陈璇,张飞飞,陈志永,隗黎丽,范玉顶,张家奇,徐敏,汤百福,刘彧,钟其旺. 不同测定方法对聚维酮碘杀菌效果的比较研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 348-353. |
[11] |
唐笑,黄凯,杨淇龄,罗志远,武林华,左腾. 高效液相色谱法检测罗非鱼血浆中L-肉碱的方法研究[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 354-360. |
[12] |
杨俊丽,吴雪,李希磊,崔龙波. 莱州湾扇贝养殖区表层沉积物质量评价[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 361-367. |
[13] |
韩耀全,何安尤,蓝家湖,吴伟军,李育森,王大鹏,雷建军,施军. 乌原鲤的胚胎发育特征[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 368-373. |
[14] |
罗志远,周宇,杨淇龄,黄凯,唐笑,武林华. L-肉碱在罗非鱼体内的药代动力学[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 374-378. |
[15] |
陈明强,陈旭,李有宁,吴洽儿,于刚,马振华,邢孔武,王理. 美济礁合浦珠母贝吊笼养殖试验[J]. 水产科学, 2018, 37(3): 379-383. |
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