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| 头足纲线粒体基因组结构分析 |
| 赵娜娜,孟学平,申欣,程汉良,阎斌伦,郑立波,朱笑琳,刘兆普 |
| 南京农业大学资源与环境科学学院,江苏海洋生物重点实验室,江苏南京210095;淮海工学院海洋学院,江苏海洋生物技术重点实验室,江苏连云港222005,淮海工学院海洋学院,江苏海洋生物技术重点实验室,江苏连云港222005,南京农业大学资源与环境科学学院,江苏海洋生物重点实验室,江苏南京210095 |
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| Analysis of Mitochondrial Genome Characteristics in Cephalopoda |
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摘要 用生物信息学方法,利用GenBank线粒体基因组全序列信息,对头足纲15个物种基因组结构进行了分析,结果显示头足纲线粒体基因组长度为15 617～20 306 bp,基因组编码链的A+T含量为59.58％～78.12％,表现出不同程度的AT偏好性；15个物种的线粒体基因组PCGs相对保守,有2个共同的基因块,可作为头足类的线粒体基因组标志;萤乌贼、鸢乌贼、茎柔鱼、太平洋褶柔鱼、大王乌贼PCGs cox1、cox2、cox3、atp6、atp8为双拷贝,且重复基因的变异很小,这是头足纲物种不同于其他物种的显著特征;多数PCGs以ATG为起始密码,以TAA为终止密码,在cox2、cob、nad2-nad6中存在不完全终止密码;在13个PCGs中,nad2和nad4L的差异最大,atp8和cox1最保守;15个种类的遗传距离为0.033～0.561,大脐鹦鹉贝与其他种类的遗传距离最大(0.529～0.561);基于线粒体基因组编码蛋白质氨基酸序列的系统发育分析结果与形态学分类结果一致.
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收稿日期: 2013-03-25
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