5种经济海胆线粒体16SrRNA基因片段的序列分析
刘晓慧,黄佳琪,周遵春,董颖
辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁省应用海洋生物技术开放实验室,辽宁,大连,116023;辽宁师范大学,辽宁,大连,116029,青岛市城阳区海洋与渔业局,山东,青岛,266109,辽宁省海洋水产科学研究院,辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室,辽宁省应用海洋生物技术开放实验室,辽宁,大连,116023
Sequence Analysis of mtDNA 16S rRNA Gene Fragments among Five Species of Sea Urchins
LIU Xiao-hui,HUANG Jia-qi,ZHOU Zun-chun,DONG Ying
摘要 对光棘球海胆、中间球海胆、马粪海胆,海刺猬和紫海胆线粒体DNA 16SrRNA基因片段进行了PCR扩增和测序,得到395 bp的可信片段.通过ClustalX 1.83和Mega 3.0软件对所得线粒体16S rRNA片段序列进行比较,共检测到118个碱基变异, 其中简约信息位点为33个.应用Mega 3.0计算各种间的相对遗传距离,以糙海参为外类群,得到NJ系统树和MP系统树,系统树各分支的置信度由"Bootstrap"1000次循环检验.结果表明,马粪海胆与光棘球海胆的亲缘关系较近,其次为中间球海胆,而紫海胆、海刺猬与这3种海胆的关系相对较远.
收稿日期: 2007-06-25
引用本文:
刘晓慧,黄佳琪,周遵春,董颖. 5种经济海胆线粒体16SrRNA基因片段的序列分析[J]. , 2007, 26(6): 331-334.
链接本文:
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2007/V26/I6/331
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