斑海豹线粒体基因组序列分析及比较研究
高祥刚，鹿志创，田甲申，韩家波，赫崇波，宋新然
辽宁省海洋水产科学研究院，辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室，辽宁大连 116023； 大连圣亚旅游控股股份有限公司，辽宁 大连 116023
Analysis and Comparison of Complete Mitochondrial Genome in Spotted Seal Phoca largha
GAO Xianggang, LU Zhichuang, TIAN Jiashen, HAN Jiabo, HE Chongbo, SONG Xinran
摘要
本研究采用LAPCR扩增和引物步移相结合的方法对我国辽东湾斑海豹的线粒体基因组全序列进行了测定，并完成了基因组成和系统发生学分析。辽东湾斑海豹线粒体基因组长为16 754 bp，其基因构成与其他海洋哺乳动物基本一致，包括37个基因（２个rRNA基因、22个tRNA基因和13个蛋白质编码基因）和1个控制区。在其37个基因中，ND6、tRNAAla 、tRNAAsn 、tRNACys 、tRNATyr 、tRNASer(UCN) 、tRNAGlu 、tRNAPro 位于Ｌ链上，其余均位于Ｈ链上。对我国辽东湾、韩国和美国阿拉斯加斑海豹线粒体基因组进行了比较分析，结果显示，三者线粒体基因组长度略有不同，差异主要体现在以重复片段形式存在的控制区序列中。值得注意的是，在编码区中，3个目标群体的线粒体ND5基因核苷酸差异最为显著，共检测到了18个突变位点，造成4处氨基酸序列变异。斑海豹线粒体基因组蛋白编码基因的变异分析及海豹科系统进化分析结果显示，我国辽东湾和韩国斑海豹的序列同源性显著高于美国阿拉斯加斑海豹，说明辽东湾和韩国斑海豹很可能来自同一个种群。
关键词 ：
斑海豹 ,
线粒体基因组 ,
结构比较 ,
系统进化
Key words ：
Phoca largha mitochondrial genome comparative structure
phylogeny
引用本文:
高祥刚，鹿志创，田甲申，韩家波，赫崇波，宋新然. 斑海豹线粒体基因组序列分析及比较研究[J]. 水产科学, 2017, 36(4): 509-513.
Phoca largha
链接本文:
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2017/V36/I4/509
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