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脊尾白虾不同发育期线粒体基因组甲基化特征分析 |
薛蓓,张培,李志辉,赵莲,赖晓芳,阎斌伦,高焕 |
淮海工学院海洋生命与水产学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,江苏 连云港 222005;江苏省海洋生物产业技术协同创新中心,江苏 连云港 222001;江苏省农业种质资源保护与利用平台,江苏 南京 210014 |
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Methylation Profile in Mitochondrial Genome of Ridgetail White Prawn Exopalaemon carinicauda in Response to Different Developmental Stages |
XUE Bei,ZHANG Pei,LI Zhihui,ZHAO Lian,LAI Xiaofang,YAN Binlun,GAO Huan |
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摘要 为研究不同发育阶段脊尾白虾线粒体基因组表观遗传学特征,本研究在筛选硫化测序引物的基础上,对不同发育期的脊尾白虾线粒体基因组甲基化特征进行了分析。经引物筛选验证,选取了4对引物在脊尾白虾的受精卵、幼体期、仔虾期和成虾期共4个发育期进行甲基化特征的分析,结果表明,除ND5基因3′端序列(21#引物扩增区)无甲基化现象外,COX3基因的起始区序列(13#引物扩增区)、COX3基因的3′端序列(16#引物扩增区)和ND5基因5′端序列(19#引物扩增区)均存在不同程度的甲基化现象。其中,COX3基因的起始区序列仅在受精卵孵化期和幼体期存在甲基化现象,COX3基因3′端序列在除受精卵外的其他3个时期均存在甲基化现象,且以上甲基化率随个体发育阶段的提高呈下降趋势;ND5基因5′端序列在4个不同发育期均存在甲基化现象,但甲基化率无显著差异。甲基化主要发生在COX3基因和ND5基因位点上,推测脊尾白虾在生长发育过程中通过调节线粒体基因组甲基化来调节机体能量代谢过程。本研究首次从整个发育周期角度探讨了线粒体基因组甲基化特征,以期为进一步揭示甲壳类生长发育相关遗传机制提供帮助。
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关键词 :
脊尾白虾,
线粒体基因组,
不同发育期,
甲基化
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Key words:
Exopalaemon carinicauda
mitochondrial genome
different developmental stage
methylation
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引用本文: |
薛蓓,张培,李志辉,赵莲,赖晓芳,阎斌伦,高焕. 脊尾白虾不同发育期线粒体基因组甲基化特征分析[J]. 水产科学, 2017, 36(5): 628-633.
XUE Bei,ZHANG Pei,LI Zhihui,ZHAO Lian,LAI Xiaofang,YAN Binlun,GAO Huan. Methylation Profile in Mitochondrial Genome of Ridgetail White Prawn Exopalaemon carinicauda in Response to Different Developmental Stages. 水产科学, 2017, 36(5): 628-633.
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链接本文: |
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2017/V36/I5/628 |
[1] |
陈建华,张庆起,高焕,阎斌伦. 不同饵料搭配对脊尾白虾幼体发育的影响[J]. 水产科学, 2017, 36(5): 662-665. |
[2] |
高祥刚,鹿志创,田甲申,韩家波,赫崇波,宋新然. 斑海豹线粒体基因组序列分析及比较研究[J]. 水产科学, 2017, 36(4): 509-513. |
[3] |
梁俊平,李健,李吉涛,刘〓萍,刘德月,戴芳钰. 脊尾白虾全人工繁育技术初步研究[J]. 水产科学, 2017, 36(3): 290-295. |
[4] |
李硕,白玉,薛蓓,娄海华,杨秀航,董逸,赖晓芳,阎斌伦,高焕. 脊尾白虾腺苷酸转移酶基因应答蜕皮的表达特征研究[J]. 水产科学, 2017, 36(2): 224-. |
[5] |
鲍相渤. 皮氏蛾螺和水泡蛾螺线粒体基因组及核糖体ITS2的比较研究[J]. , 2016, 35(6): 686-692. |
[6] |
段亚飞,张喆,李吉涛,李健,刘萍. 脊尾白虾血细胞ESTs的生物信息学与微卫星序列特征分析[J]. , 2016, 35(5): 562-567. |
[7] |
凌云,王李宝,万夕和,沈辉,黎慧. 江苏南部池养脊尾白虾不同组织中重金属分布特征研究[J]. , 2015, 34(5): 316-320. |
[8] |
李石磊,张明,王庆志,王笑月,李大成,刘卫东,刘忠颖,陈远. 16种环节动物线粒体基因排列、特征比较及系统发育分析[J]. , 2015, 34(2): 104-112. |
[9] |
段亚飞,梁俊平,李吉涛,王芸,张喆,李健,刘萍. 鳗弧菌感染对脊尾白虾鳃组织抗氧化酶系统的影响[J]. , 2015, (11): 667-672. |
[10] |
王庚申,谢建军,施慧,许文军. 盐度对脊尾白虾生长及肝胰腺消化酶活力的影响[J]. , 2014, 33(7): 451-454. |
[11] |
赵娜娜,孟学平,申欣,程汉良,阎斌伦,郑立波,朱笑琳,刘兆普. 头足纲线粒体基因组结构分析[J]. , 2013, 32(3): 146-152. |
[12] |
孟学平,申欣,赵娜娜,田美,郑立波,程汉良,阎斌伦,董志国. 双壳类线粒体基因组结构分析[J]. , 2013, (12): 721-729. |
[13] |
梁俊平,李健,李吉涛,刘萍,戴芳钰,刘德月. 氨氮对脊尾白虾幼虾和成虾的毒性试验[J]. , 2012, 31(9): 526-529. |
[14] |
申欣. 星虫动物线粒体基因组全序列的基因排列和特征比较[J]. , 2012, 31(9): 554-559. |
[15] |
李云峰,李梦遥,王健,高祥刚,赫崇波,周遵春,杨爱馥. 仿刺参线粒体全基因组序列结构及比较研究[J]. , 2012, 31(8): 454-462. |
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