克氏原螯虾微卫星文库构建及多态性分析
宋丹丹，王龙，魏红静，史文竞，朱传坤
淮阴师范学院生命科学学院，江苏省特色水产繁育工程实验室，江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心，江苏 淮安 223300
Construction and Polymorphism Analysis of a Microsatellite Library in Red Swamp Crayfish Procambarus clarkii
SONG Dandan, WANG Long, WEI Hongjing, SHI Wenjing, ZHU Chuankun
摘要 采用磁珠富集法构建了克氏原螯虾(GT)n 重复类型的微卫星富集文库。随机检测了82个克隆，其中有78个为阳性，阳性率达95.1%。对75个阳性单克隆进行测序后，共获得序列57条，其中43条含有微卫星序列，微卫星富集效率为75.4%。根据43条含微卫星的序列共设计了21对引物，其中18对可扩增出稳定条带，并且有9对表现为多态性。在测试群体中对9个多态标记的检测结果显示，等位基因数为2~6个（平均4个），观测杂合度为0.3522~0.6667（平均0.5856），期望杂合度为0.3704~0.8390（平均0.6291），多态信息含量为0.2859~0.8001（平均0.5584）。本研究开发的微卫星标记将为今后克氏原螯虾及其近缘物种的群体遗传结构分析、种质资源保护、遗传图谱构建等遗传学和基因组学研究提供有利工具。
关键词 ：
克氏原螯虾 ,
磁珠富集法 ,
微卫星文库 ,
多态性
Key words ：
Procambarus clarkia magnetic bead enrichment microsatellite library
polymorphism
引用本文:
宋丹丹，王龙，魏红静，史文竞，朱传坤. 克氏原螯虾微卫星文库构建及多态性分析[J]. 水产科学, 2019, 38(6): 819-826.
Procambarus clarkii
链接本文:
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2019/V38/I6/819
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