海蜇微卫星标记开发及自然、养殖群体遗传多样性分析
卢彦先，狄明玉，李云峰，周遵春，侯红漫，赫崇波，王绍政，高美玲
大连花园口经济区农村经济发展局，辽宁 大连 116000； 大连工业大学 食品科学与工程学院，辽宁 大连 116034； 辽宁省海洋水产科学研究院，辽宁 大连 116023； 大连理工大学 生命科学与技术学院，辽宁 大连 116024
Microsatellite Analysis of Genetic Diversity in Wild and Cultured Populations of Jellyfish Rhopilema esculentum
LU Yanxian, DI Mingyu, LI Yunfeng, ZHOU Zunchun, HOU Hongman, HE Chongbo,WANG Shaozheng，GAO Meiling
摘要 为探明海蜇养殖群体的种质情况，了解海蜇自然群体与养殖群体的遗传多样性水平，本研究基于Illumina高通量测序获得的海蜇转录组数据，利用MISA软件筛选出5088个微卫星位点，挑选出100个微卫星位点设计引物，58个位点扩增出目的条带，其中25对微卫星引物具有多态性，并对江苏自然群体和辽宁养殖群体进行遗传多样性分析。结果显示，江苏自然群体和辽宁养殖群体的平均等位基因数分别为3.120、2.360，有效等位基因数分别为2.112、1.738，期望杂合度平均值分别为0.495、0.378，多态信息含量均值分别为0.420、0.311，香农信息指数均值分别为0.823、0.593。统计结果显示，两个群体的遗传多样性处于中度多态性水平，自然群体的遗传多样性水平稍高于养殖群体。本研究的结果为海蜇遗传改良、遗传连锁图谱构建和种质资源评价等方面的研究提供理论基础和参考资料。
关键词 ：
海蜇 ,
自然群体 ,
养殖群体 ,
微卫星 ,
遗传多样性
Key words ：
Rhopilema esculentum wild population cultured population
microsatellite
genetic diversity
引用本文:
卢彦先，狄明玉，李云峰，周遵春，侯红漫，赫崇波，王绍政，高美玲. 海蜇微卫星标记开发及自然、养殖群体遗传多样性分析[J]. 水产科学, 2017, 36(4): 472-479.
Rhopilema esculentum . Fisheries Science, 2017, 36(4): 472-479.
链接本文:
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2017/V36/I4/472
[1]
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[3]
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