基于COⅠ序列绒螯蟹属DNA条形码和遗传多样性研究
徐洁,王晓梅,李晶晶,陈池,李转转,张玲颖
天津农学 院水产学院,天津市水产生态及养殖重点实验室,天津 300384; 天津市水生动物疫病预防控制中心,天津 300402
DNA Barcoding and Genetic Diversity in Genus Eriocheir Based on COⅠ Gene Sequences
XU Jie, WANG Xiaomei, LI Jingjing, CHEN Chi, LI Zhuanzhuan, ZHANG Lingying
摘要 对绒螯蟹属的中华绒螯蟹如东和七里海群体、日本绒螯蟹、合浦绒螯蟹及狭颚绒螯蟹共80条线粒体COⅠ片段进行扩增和测序,并与GenBank中绒螯蟹属的台湾绒螯蟹2条和近方蟹属的绒毛近方蟹19条COⅠ 基因序列进行联配分析。结果显示,101条序列包含44种单倍型,序列组成表现明显的碱基偏倚性。中华绒螯蟹如东、七里海群体与日本绒螯蟹间的遗传距离分别为1.210%和1.078%,明显低于COⅠ基因DNA条形码鉴别种的遗传距离为2%的阈值,表明中华绒螯蟹和日本绒螯蟹为同一物种;而合浦绒螯蟹与中华绒螯蟹如东和七里海群体及与日本绒螯蟹的遗传距离分别为4.823%、5.101%以及5.011%,明显大于2%的鉴别阈值,说明合浦绒螯蟹为独立的种。以绒毛近方蟹为外群,基于群体内及群体间的遗传距离构建的邻接树显示,中华绒螯蟹与日本绒螯蟹聚在一起,合浦绒螯蟹则聚成单系。本文测序的5个群体除狭颚绒螯蟹外,其余均具有遗传多样性,单倍型多样性为0.593±0.144~0.779±0.068,核苷酸多样性为0.00156~0.01336;此外,中华绒螯蟹如东群体与日本绒螯蟹、合浦绒螯蟹和中华绒螯蟹七里海群体分别共享单倍型H1、H2和H3,说明这些蟹类可能有种质资源混杂或是遗传污染的现象。
关键词 :
绒螯蟹 ,
COⅠ基因 ,
DNA条形码 ,
物种鉴定 ,
遗传多样性
Key words :
Eriocheir
COⅠ gene
DNA barcode
species identification
genetic diversity
引用本文:
徐洁,王晓梅,李晶晶,陈池,李转转,张玲颖. 基于COⅠ序列绒螯蟹属DNA条形码和遗传多样性研究 [J]. 水产科学, 2017, 36(4): 480-487.
XU Jie, WANG Xiaomei, LI Jingjing, CHEN Chi, LI Zhuanzhuan, ZHANG Lingying. DNA Barcoding and Genetic Diversity in Genus Eriocheir Based on COⅠ Gene Sequences . 水产科学, 2017, 36(4): 480-487.
链接本文:
http://www.shchkx.com/CN/ 或 http://www.shchkx.com/CN/Y2017/V36/I4/480
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